Шакен Айманов родился 15.02.1914 в Баян-Ауле (по другим источникам — в Баянаульском районе[1]) (ныне — Павлодарской области Казахстана) в семье крестьянина-скотовода. Его настоящее имя Шахкерим (Шаһкерім)[2].
В 1928 году окончил среднюю школу[3]. В 1931—1933 годах учился в Казахском педагогическом техникуме в Семипалатинске.
В 1933 году по приглашению писателя Г. М. Мусрепова приехал в Алма-Ату и был принят в труппу Казахского театра драмы (ныне Казахский государственный академический театр драмы им. М.О. Ауэзова), в 1947—1951 годах — главный режиссёр и художественный руководитель этого театра, где работал до 1953 года.
За время работы в театре проявил актёрское мастерство, которому была присуща яркость психологической характеристики[4].
С 1938 года снимался в кино, с 1954 года — кинорежиссёр киностудии «Казахфильм».
С 1963 года — первый секретарь правления Союза композиторов Казахской ССР.
Избирался депутатом ВС Казахской ССР 4 и 7 созывов.